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遵义医学院教务处以其科学的管理方法、先进的管理手段、精干的管理队伍、高效的管理能力以及优质的服务态度受到了国家教育部、省教育厅及兄弟院校的一致认可和好评,工作成绩显著。先后被评为全国普通高等学校优秀教务处、全国高等教育学籍学历管理先进集体、贵州省普通高等学校优秀教务处、贵州省普通高等学校教学管理先进集体、贵州省高等教育学籍学历管理先进集体、贵州省社会证书考试优秀考点、遵义医学院教学管理先进单位;3人荣获贵州省普通高等学校教学管理先进个人称号, 2人被评为贵州省普通高等学校学籍管理先进个人,1人被评为贵州省社会证书考试先进个人。

教务处现下设办公室、教务科、教材科、实习管理科、考试中心、教育与质量控制中心。另外设立了学生教学信息中心、学生互助学习中心,挂靠教育与质量控制中心,各个科室分工明确、协调合作、团结创新、严谨务实,积极开展教学管理活动,包括专业培养方案、教学运行、教学质量管理与评价,以及专业、课程、教材、实验室、实践教学基地、学风、教学管理制度等教学基本建设管理以及教学研究与改革等。